Aux termes du sous-alinéa 12.2.31 de l’Accord sur les revendications territoriales du Nunavut, les dépenses de la CNER sont à la charge du Gouvernement. Chaque année, la CNER doit produire des états financiers audités de tous ses revenus gouvernementaux.  Elle les rend publiquement disponibles et doit les intégrer dans son rapport annuel public qui regroupe des informations sur toutes ses activités, ses initiatives, ses changements de personnel, etc.